Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB4P17483 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB4P17483 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms