Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD1P17405 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms