Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF4P15884 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF4P15884 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCF4P15884 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCF4P15884 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCF4P15884 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCF4P15884 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TCF4P15884 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCF4P15884 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF4P15884 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF4P15884 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF4P15884 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCF4P15884 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCF4P15884 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms