Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP2C9P11712 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYP2C9P11712 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms