Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD28P10747 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD28P10747 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD28P10747 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD28P10747 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD28P10747 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms