Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAVP06756 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAVP06756 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms