Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBB4AP04350 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms