Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB11O95342 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms