Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GMDSO60547 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GMDSO60547 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GMDSO60547 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GMDSO60547 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMDSO60547 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMDSO60547 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMDSO60547 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GMDSO60547 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms