Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCRIPO60506 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms