Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCH6O60337 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MARCH6O60337 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MARCH6O60337 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MARCH6O60337 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCH6O60337 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCH6O60337 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms