Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSI1O43347 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSI1O43347 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSI1O43347 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSI1O43347 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSI1O43347 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSI1O43347 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSI1O43347 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSI1O43347 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MSI1O43347 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MSI1O43347 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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