Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAA1O43292 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPAA1O43292 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms