Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA3EO15041 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3EO15041 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms