Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLIM4O00461 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLIM4O00461 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms