Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
B4DXG7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
B4DXG7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
B4DXG7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
B4DXG7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
B4DXG7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
B4DXG7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
B4DXG7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
B4DXG7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms