Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms