Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F8A0AVK6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F8A0AVK6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms