Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TCRBV5S1A1TA0A578 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TCRBV5S1A1TA0A578 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TCRBV5S1A1TA0A578 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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TCRBV5S1A1TA0A578 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TCRBV5S1A1TA0A578 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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