Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CtsfQ9R013 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CtsfQ9R013 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CtsfQ9R013 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CtsfQ9R013 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CtsfQ9R013 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CtsfQ9R013 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CtsfQ9R013 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CtsfQ9R013 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CtsfQ9R013 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CtsfQ9R013 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CtsfQ9R013 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CtsfQ9R013 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CtsfQ9R013 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtsfQ9R013 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CtsfQ9R013 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms