Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Map1aQ9QYR6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Map1aQ9QYR6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Map1aQ9QYR6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Map1aQ9QYR6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Map1aQ9QYR6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Map1aQ9QYR6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map1aQ9QYR6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map1aQ9QYR6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Map1aQ9QYR6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map1aQ9QYR6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Map1aQ9QYR6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Map1aQ9QYR6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Map1aQ9QYR6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Map1aQ9QYR6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms