Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rai2Q9QVY8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Rai2Q9QVY8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Rai2Q9QVY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Rai2Q9QVY8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Rai2Q9QVY8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Rai2Q9QVY8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Rai2Q9QVY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rai2Q9QVY8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rai2Q9QVY8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Rai2Q9QVY8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Rai2Q9QVY8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Rai2Q9QVY8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,64■■□□□ 1,54
Rai2Q9QVY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24,64■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Rai2Q9QVY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Rai2Q9QVY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Rai2Q9QVY8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Rai2Q9QVY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,4 ms