Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms