Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr1Q9EPQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr1Q9EPQ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tlr1Q9EPQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tlr1Q9EPQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tlr1Q9EPQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tlr1Q9EPQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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