Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syde1Q9DBZ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syde1Q9DBZ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syde1Q9DBZ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syde1Q9DBZ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde1Q9DBZ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syde1Q9DBZ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Syde1Q9DBZ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syde1Q9DBZ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syde1Q9DBZ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms