Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PudpQ9D5U5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PudpQ9D5U5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PudpQ9D5U5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PudpQ9D5U5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PudpQ9D5U5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PudpQ9D5U5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms