Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mis12Q9CY25 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mis12Q9CY25 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mis12Q9CY25 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mis12Q9CY25 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mis12Q9CY25 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mis12Q9CY25 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Mis12Q9CY25 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mis12Q9CY25 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mis12Q9CY25 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mis12Q9CY25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Mis12Q9CY25 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mis12Q9CY25 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mis12Q9CY25 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mis12Q9CY25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mis12Q9CY25 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms