Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim12aQ99PQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim12aQ99PQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim12aQ99PQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim12aQ99PQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim12aQ99PQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim12aQ99PQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim12aQ99PQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim12aQ99PQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim12aQ99PQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim12aQ99PQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim12aQ99PQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim12aQ99PQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim12aQ99PQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim12aQ99PQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim12aQ99PQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim12aQ99PQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim12aQ99PQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim12aQ99PQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim12aQ99PQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim12aQ99PQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12aQ99PQ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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