Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Rrbp1Q99PL5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rrbp1Q99PL5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rrbp1Q99PL5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rrbp1Q99PL5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Rrbp1Q99PL5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rrbp1Q99PL5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Rrbp1Q99PL5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Rrbp1Q99PL5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Rrbp1Q99PL5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Rrbp1Q99PL5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Rrbp1Q99PL5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Rrbp1Q99PL5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Rrbp1Q99PL5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rrbp1Q99PL5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Rrbp1Q99PL5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rrbp1Q99PL5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rrbp1Q99PL5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Rrbp1Q99PL5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rrbp1Q99PL5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Rrbp1Q99PL5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Rrbp1Q99PL5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rrbp1Q99PL5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Rrbp1Q99PL5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Rrbp1Q99PL5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Rrbp1Q99PL5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
Rrbp1Q99PL5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rrbp1Q99PL5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Rrbp1Q99PL5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Rrbp1Q99PL5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Rrbp1Q99PL5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
Rrbp1Q99PL5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
Rrbp1Q99PL5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Rrbp1Q99PL5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Rrbp1Q99PL5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rrbp1Q99PL5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rrbp1Q99PL5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Rrbp1Q99PL5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rrbp1Q99PL5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rrbp1Q99PL5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rrbp1Q99PL5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rrbp1Q99PL5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rrbp1Q99PL5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Rrbp1Q99PL5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Rrbp1Q99PL5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Rrbp1Q99PL5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rrbp1Q99PL5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rrbp1Q99PL5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rrbp1Q99PL5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rrbp1Q99PL5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rrbp1Q99PL5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rrbp1Q99PL5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Rrbp1Q99PL5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Rrbp1Q99PL5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rrbp1Q99PL5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Rrbp1Q99PL5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Rrbp1Q99PL5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rrbp1Q99PL5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Rrbp1Q99PL5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Rrbp1Q99PL5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms