Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smim11aQ99J19 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smim11aQ99J19 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smim11aQ99J19 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smim11aQ99J19 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smim11aQ99J19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smim11aQ99J19 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smim11aQ99J19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim11aQ99J19 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim11aQ99J19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms