Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
Cacna1dQ99246 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,04■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cacna1dQ99246 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cacna1dQ99246 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Cacna1dQ99246 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cacna1dQ99246 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Cacna1dQ99246 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Cacna1dQ99246 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Cacna1dQ99246 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Cacna1dQ99246 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Cacna1dQ99246 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Cacna1dQ99246 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Cacna1dQ99246 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Cacna1dQ99246 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Cacna1dQ99246 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24,58■■□□□ 1,53
Cacna1dQ99246 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Cacna1dQ99246 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Cacna1dQ99246 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Cacna1dQ99246 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cacna1dQ99246 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cacna1dQ99246 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,9 ms