Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT4

Dnajc17, DnaJ homolog subfamily C member 17, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc17Q91WT4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnajc17Q91WT4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnajc17Q91WT4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnajc17Q91WT4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnajc17Q91WT4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnajc17Q91WT4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Dnajc17Q91WT4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnajc17Q91WT4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnajc17Q91WT4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnajc17Q91WT4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnajc17Q91WT4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnajc17Q91WT4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnajc17Q91WT4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnajc17Q91WT4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnajc17Q91WT4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dnajc17Q91WT4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnajc17Q91WT4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnajc17Q91WT4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dnajc17Q91WT4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dnajc17Q91WT4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Dnajc17Q91WT4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dnajc17Q91WT4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Dnajc17Q91WT4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dnajc17Q91WT4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnajc17Q91WT4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dnajc17Q91WT4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnajc17Q91WT4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnajc17Q91WT4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnajc17Q91WT4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dnajc17Q91WT4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dnajc17Q91WT4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dnajc17Q91WT4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dnajc17Q91WT4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnajc17Q91WT4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dnajc17Q91WT4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dnajc17Q91WT4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnajc17Q91WT4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dnajc17Q91WT4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dnajc17Q91WT4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dnajc17Q91WT4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dnajc17Q91WT4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dnajc17Q91WT4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dnajc17Q91WT4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajc17Q91WT4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajc17Q91WT4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dnajc17Q91WT4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dnajc17Q91WT4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms