Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx18Q8VDS8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx18Q8VDS8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx18Q8VDS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx18Q8VDS8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx18Q8VDS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx18Q8VDS8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx18Q8VDS8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx18Q8VDS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx18Q8VDS8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx18Q8VDS8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stx18Q8VDS8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx18Q8VDS8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx18Q8VDS8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx18Q8VDS8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx18Q8VDS8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx18Q8VDS8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx18Q8VDS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx18Q8VDS8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx18Q8VDS8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx18Q8VDS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx18Q8VDS8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms