Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0N9

Zdhhc1, Probable palmitoyltransferase ZDHHC1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc1Q8R0N9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zdhhc1Q8R0N9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zdhhc1Q8R0N9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zdhhc1Q8R0N9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zdhhc1Q8R0N9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zdhhc1Q8R0N9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zdhhc1Q8R0N9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zdhhc1Q8R0N9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zdhhc1Q8R0N9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zdhhc1Q8R0N9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zdhhc1Q8R0N9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zdhhc1Q8R0N9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zdhhc1Q8R0N9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zdhhc1Q8R0N9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zdhhc1Q8R0N9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zdhhc1Q8R0N9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms