Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Abca9Q8K449 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38,2■■■■□ 3,71
Abca9Q8K449 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Abca9Q8K449 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Abca9Q8K449 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38,19■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Abca9Q8K449 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Abca9Q8K449 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38,12■■■■□ 3,69
Abca9Q8K449 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38,11■■■■□ 3,69
Abca9Q8K449 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Abca9Q8K449 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38,06■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38,05■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,05■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38,04■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,02■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,68
Abca9Q8K449 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37,95■■■■□ 3,67
Abca9Q8K449 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Abca9Q8K449 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Abca9Q8K449 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Abca9Q8K449 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Abca9Q8K449 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37,83■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37,82■■■■□ 3,65
Abca9Q8K449 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37,81■■■■□ 3,64
Abca9Q8K449 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Abca9Q8K449 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Abca9Q8K449 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Abca9Q8K449 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Abca9Q8K449 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Abca9Q8K449 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,63
Abca9Q8K449 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37,72■■■■□ 3,63
Abca9Q8K449 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Abca9Q8K449 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37,7■■■■□ 3,63
Abca9Q8K449 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,7■■■■□ 3,63
Abca9Q8K449 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,69■■■■□ 3,62
Abca9Q8K449 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,69■■■■□ 3,62
Abca9Q8K449 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37,69■■■■□ 3,62
Abca9Q8K449 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Abca9Q8K449 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Abca9Q8K449 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Abca9Q8K449 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Abca9Q8K449 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Abca9Q8K449 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37,62■■■■□ 3,61
Abca9Q8K449 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37,61■■■■□ 3,61
Abca9Q8K449 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Abca9Q8K449 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Abca9Q8K449 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37,6■■■■□ 3,61
Abca9Q8K449 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Abca9Q8K449 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Abca9Q8K449 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37,57■■■■□ 3,61
Abca9Q8K449 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,54■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37,53■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Abca9Q8K449 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37,51■■■■□ 3,59
Abca9Q8K449 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37,49■■■■□ 3,59
Abca9Q8K449 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Abca9Q8K449 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Abca9Q8K449 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37,48■■■■□ 3,59
Abca9Q8K449 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Abca9Q8K449 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,5 ms