Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cdk5rap2Q8K389 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Cdk5rap2Q8K389 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cdk5rap2Q8K389 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Cdk5rap2Q8K389 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cdk5rap2Q8K389 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cdk5rap2Q8K389 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cdk5rap2Q8K389 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cdk5rap2Q8K389 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cdk5rap2Q8K389 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk5rap2Q8K389 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk5rap2Q8K389 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk5rap2Q8K389 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cdk5rap2Q8K389 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cdk5rap2Q8K389 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cdk5rap2Q8K389 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cdk5rap2Q8K389 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cdk5rap2Q8K389 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cdk5rap2Q8K389 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cdk5rap2Q8K389 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Cdk5rap2Q8K389 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cdk5rap2Q8K389 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cdk5rap2Q8K389 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cdk5rap2Q8K389 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cdk5rap2Q8K389 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cdk5rap2Q8K389 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cdk5rap2Q8K389 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cdk5rap2Q8K389 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cdk5rap2Q8K389 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk5rap2Q8K389 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk5rap2Q8K389 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cdk5rap2Q8K389 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cdk5rap2Q8K389 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cdk5rap2Q8K389 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cdk5rap2Q8K389 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cdk5rap2Q8K389 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cdk5rap2Q8K389 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cdk5rap2Q8K389 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cdk5rap2Q8K389 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cdk5rap2Q8K389 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cdk5rap2Q8K389 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cdk5rap2Q8K389 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdk5rap2Q8K389 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdk5rap2Q8K389 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdk5rap2Q8K389 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cdk5rap2Q8K389 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cdk5rap2Q8K389 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cdk5rap2Q8K389 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cdk5rap2Q8K389 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cdk5rap2Q8K389 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cdk5rap2Q8K389 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cdk5rap2Q8K389 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Cdk5rap2Q8K389 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cdk5rap2Q8K389 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cdk5rap2Q8K389 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cdk5rap2Q8K389 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cdk5rap2Q8K389 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms