Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIV8

Tbce, Tubulin-specific chaperone E, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbceQ8CIV8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TbceQ8CIV8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TbceQ8CIV8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TbceQ8CIV8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TbceQ8CIV8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TbceQ8CIV8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TbceQ8CIV8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TbceQ8CIV8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbceQ8CIV8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbceQ8CIV8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TbceQ8CIV8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TbceQ8CIV8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms