Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfx6Q8C7R7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx6Q8C7R7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfx6Q8C7R7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfx6Q8C7R7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx6Q8C7R7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx6Q8C7R7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfx6Q8C7R7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfx6Q8C7R7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfx6Q8C7R7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfx6Q8C7R7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rfx6Q8C7R7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rfx6Q8C7R7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rfx6Q8C7R7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfx6Q8C7R7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx6Q8C7R7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx6Q8C7R7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx6Q8C7R7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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