Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Snx17Q8BVL3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx17Q8BVL3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx17Q8BVL3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx17Q8BVL3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx17Q8BVL3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snx17Q8BVL3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx17Q8BVL3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Snx17Q8BVL3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx17Q8BVL3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx17Q8BVL3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Snx17Q8BVL3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx17Q8BVL3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx17Q8BVL3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx17Q8BVL3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx17Q8BVL3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx17Q8BVL3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx17Q8BVL3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx17Q8BVL3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx17Q8BVL3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx17Q8BVL3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx17Q8BVL3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx17Q8BVL3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms