Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zbed4Q80WQ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zbed4Q80WQ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zbed4Q80WQ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zbed4Q80WQ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zbed4Q80WQ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zbed4Q80WQ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed4Q80WQ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed4Q80WQ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zbed4Q80WQ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zbed4Q80WQ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zbed4Q80WQ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed4Q80WQ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed4Q80WQ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Zbed4Q80WQ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbed4Q80WQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zbed4Q80WQ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zbed4Q80WQ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zbed4Q80WQ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zbed4Q80WQ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zbed4Q80WQ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zbed4Q80WQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms