Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NinlQ6ZQ12 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NinlQ6ZQ12 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NinlQ6ZQ12 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NinlQ6ZQ12 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NinlQ6ZQ12 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NinlQ6ZQ12 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NinlQ6ZQ12 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NinlQ6ZQ12 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NinlQ6ZQ12 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NinlQ6ZQ12 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NinlQ6ZQ12 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NinlQ6ZQ12 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NinlQ6ZQ12 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NinlQ6ZQ12 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NinlQ6ZQ12 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NinlQ6ZQ12 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NinlQ6ZQ12 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NinlQ6ZQ12 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NinlQ6ZQ12 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NinlQ6ZQ12 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NinlQ6ZQ12 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NinlQ6ZQ12 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NinlQ6ZQ12 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
NinlQ6ZQ12 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NinlQ6ZQ12 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NinlQ6ZQ12 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NinlQ6ZQ12 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NinlQ6ZQ12 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NinlQ6ZQ12 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NinlQ6ZQ12 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NinlQ6ZQ12 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NinlQ6ZQ12 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NinlQ6ZQ12 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NinlQ6ZQ12 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NinlQ6ZQ12 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NinlQ6ZQ12 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NinlQ6ZQ12 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NinlQ6ZQ12 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NinlQ6ZQ12 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NinlQ6ZQ12 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NinlQ6ZQ12 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NinlQ6ZQ12 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NinlQ6ZQ12 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NinlQ6ZQ12 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NinlQ6ZQ12 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NinlQ6ZQ12 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NinlQ6ZQ12 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NinlQ6ZQ12 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 385.4 ms