Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wdr44Q6NVE8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Wdr44Q6NVE8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Wdr44Q6NVE8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Wdr44Q6NVE8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Wdr44Q6NVE8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Wdr44Q6NVE8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Wdr44Q6NVE8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Wdr44Q6NVE8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Wdr44Q6NVE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Wdr44Q6NVE8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Wdr44Q6NVE8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Wdr44Q6NVE8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms