Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
SphkapQ6NSW3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SphkapQ6NSW3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SphkapQ6NSW3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SphkapQ6NSW3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SphkapQ6NSW3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SphkapQ6NSW3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SphkapQ6NSW3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SphkapQ6NSW3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SphkapQ6NSW3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SphkapQ6NSW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SphkapQ6NSW3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SphkapQ6NSW3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SphkapQ6NSW3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SphkapQ6NSW3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SphkapQ6NSW3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SphkapQ6NSW3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
SphkapQ6NSW3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SphkapQ6NSW3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SphkapQ6NSW3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SphkapQ6NSW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SphkapQ6NSW3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SphkapQ6NSW3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SphkapQ6NSW3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SphkapQ6NSW3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SphkapQ6NSW3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SphkapQ6NSW3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SphkapQ6NSW3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SphkapQ6NSW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SphkapQ6NSW3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SphkapQ6NSW3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SphkapQ6NSW3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SphkapQ6NSW3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
SphkapQ6NSW3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
SphkapQ6NSW3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SphkapQ6NSW3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SphkapQ6NSW3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SphkapQ6NSW3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SphkapQ6NSW3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SphkapQ6NSW3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SphkapQ6NSW3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
SphkapQ6NSW3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SphkapQ6NSW3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SphkapQ6NSW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SphkapQ6NSW3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SphkapQ6NSW3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SphkapQ6NSW3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SphkapQ6NSW3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SphkapQ6NSW3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SphkapQ6NSW3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SphkapQ6NSW3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SphkapQ6NSW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SphkapQ6NSW3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SphkapQ6NSW3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SphkapQ6NSW3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SphkapQ6NSW3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SphkapQ6NSW3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SphkapQ6NSW3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms