Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sohlh1Q6IUP1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sohlh1Q6IUP1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sohlh1Q6IUP1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sohlh1Q6IUP1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sohlh1Q6IUP1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sohlh1Q6IUP1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sohlh1Q6IUP1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sohlh1Q6IUP1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sohlh1Q6IUP1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sohlh1Q6IUP1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sohlh1Q6IUP1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sohlh1Q6IUP1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sohlh1Q6IUP1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sohlh1Q6IUP1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sohlh1Q6IUP1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sohlh1Q6IUP1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sohlh1Q6IUP1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sohlh1Q6IUP1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sohlh1Q6IUP1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sohlh1Q6IUP1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms