Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Sbno1Q689Z5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
Sbno1Q689Z5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Sbno1Q689Z5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Sbno1Q689Z5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Sbno1Q689Z5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Sbno1Q689Z5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Sbno1Q689Z5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Sbno1Q689Z5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Sbno1Q689Z5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Sbno1Q689Z5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34,55■■■■□ 3,12
Sbno1Q689Z5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Sbno1Q689Z5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Sbno1Q689Z5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34,49■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,47■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Sbno1Q689Z5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Sbno1Q689Z5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Sbno1Q689Z5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Sbno1Q689Z5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Sbno1Q689Z5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Sbno1Q689Z5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Sbno1Q689Z5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Sbno1Q689Z5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Sbno1Q689Z5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Sbno1Q689Z5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Sbno1Q689Z5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Sbno1Q689Z5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Sbno1Q689Z5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Sbno1Q689Z5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Sbno1Q689Z5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Sbno1Q689Z5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Sbno1Q689Z5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Sbno1Q689Z5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Sbno1Q689Z5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Sbno1Q689Z5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Sbno1Q689Z5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Sbno1Q689Z5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Sbno1Q689Z5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Sbno1Q689Z5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Sbno1Q689Z5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,04
Sbno1Q689Z5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Sbno1Q689Z5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3,03
Sbno1Q689Z5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Sbno1Q689Z5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Sbno1Q689Z5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Sbno1Q689Z5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,4 ms