Protein–RNA interactions for Protein: Q64436

Atp4a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4aQ64436 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp4aQ64436 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp4aQ64436 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp4aQ64436 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp4aQ64436 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp4aQ64436 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp4aQ64436 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp4aQ64436 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp4aQ64436 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp4aQ64436 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp4aQ64436 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp4aQ64436 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp4aQ64436 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp4aQ64436 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp4aQ64436 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp4aQ64436 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp4aQ64436 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp4aQ64436 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms