Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PatjQ63ZW7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PatjQ63ZW7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PatjQ63ZW7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PatjQ63ZW7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PatjQ63ZW7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PatjQ63ZW7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PatjQ63ZW7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PatjQ63ZW7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PatjQ63ZW7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PatjQ63ZW7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PatjQ63ZW7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PatjQ63ZW7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PatjQ63ZW7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PatjQ63ZW7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PatjQ63ZW7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PatjQ63ZW7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PatjQ63ZW7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PatjQ63ZW7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PatjQ63ZW7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PatjQ63ZW7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PatjQ63ZW7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PatjQ63ZW7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PatjQ63ZW7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PatjQ63ZW7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PatjQ63ZW7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PatjQ63ZW7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PatjQ63ZW7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PatjQ63ZW7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PatjQ63ZW7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PatjQ63ZW7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms