Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd33Q63994 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd33Q63994 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd33Q63994 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd33Q63994 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd33Q63994 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd33Q63994 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd33Q63994 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd33Q63994 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd33Q63994 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd33Q63994 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd33Q63994 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd33Q63994 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms