Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nptx1Q62443 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nptx1Q62443 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx1Q62443 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx1Q62443 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx1Q62443 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx1Q62443 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx1Q62443 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx1Q62443 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx1Q62443 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx1Q62443 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nptx1Q62443 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx1Q62443 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx1Q62443 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nptx1Q62443 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nptx1Q62443 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx1Q62443 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms