Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MslnQ61468 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MslnQ61468 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MslnQ61468 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MslnQ61468 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MslnQ61468 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MslnQ61468 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MslnQ61468 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MslnQ61468 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MslnQ61468 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MslnQ61468 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MslnQ61468 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MslnQ61468 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MslnQ61468 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MslnQ61468 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MslnQ61468 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MslnQ61468 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MslnQ61468 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MslnQ61468 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MslnQ61468 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MslnQ61468 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MslnQ61468 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MslnQ61468 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MslnQ61468 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MslnQ61468 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MslnQ61468 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MslnQ61468 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MslnQ61468 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MslnQ61468 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MslnQ61468 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MslnQ61468 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MslnQ61468 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MslnQ61468 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MslnQ61468 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MslnQ61468 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MslnQ61468 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MslnQ61468 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MslnQ61468 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MslnQ61468 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MslnQ61468 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MslnQ61468 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MslnQ61468 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MslnQ61468 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MslnQ61468 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MslnQ61468 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms