Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata6Q61169 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gata6Q61169 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gata6Q61169 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata6Q61169 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gata6Q61169 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gata6Q61169 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gata6Q61169 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gata6Q61169 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms